A causa di un eccessivo incremento demografico della popolazione mondiale, gli esseri umani hanno iniziato a trasferirsi nello spazio. Nel 79° anno di questa era, in una zona invasa da detriti e tormentata da scariche elettriche, infuria la battaglia tra il Principato di Zeon e le forze della Federazione per il controllo del territorio...
Grazie allo Psycho Zaku di Lorenz, che ha sbaragliato il Full Armor Gundam pilotato da Flemming, gli effetti diabolici del Reuse P Device sono dimostrati. Sette mesi dopo la fine della Guerra di Un Anno, i dati a esso relativi sono passati nelle mani di una setta religiosa chiamata Alleanza dei Mari del Sud, e lo scontro tra il sergente maggiore e il sottotenente è destinato a riaprirsi sulla Terra...