Akira è uno studente timido e poco coraggioso che ha un rapporto problematico con la tecnologia. Temendo che i compagni possano allontanarlo per via del suo carattere, decide di compiere il primo passo verso il cambiamento aiutando una ragazza in difficoltà. Tuttavia viene investito da un camion e, ironia della sorte, si risveglia anni dopo sotto forma di EX-ARM 00, un’arma tecnologicamente avanzata dalla coscienza umana e dalle potenzialità sconosciute…
La Sezione Anti-EX-ARM, infiltrata nel cervello di Akira, riesce a recuperare un frammento dei suoi ricordi di dieci anni prima, dove si vede un “finto Akira” sul punto di distruggere Tokyo. Chi sia lui in realtà e cosa sia questa EX-ARM 11 in grado di controllare la forza di gravità resta un mistero. Ancora in cerca della verità, Akira e Shiga risolvono senza troppi problemi un caso di una civile in possesso di un’EX-ARM, ma subito dopo iniziano a circolare dei preoccupanti inviti a una “vendita all’asta di EX-ARM”…