Anno 2020. Il giovane Tokio Kuryu è affascinato come tanti coetanei dal videogioco di ruolo online “The World R:X”, versione aggiornata del popolare MMORPG “The World”. Il ragazzo vive una comune vita da giocatore finché un giorno arriva nella sua scuola Saika Amagi, una ragazza in grado di trasferirsi “corpo e anima” direttamente in rete. La storia continua nei capitoli del manga scritti dal team di sviluppo di CyberConnect2 e disegnati da Kikuya Megane sulla rivista KeroKero Ace di Kadokawa Shoten a partire dal 2007: grazie a Saika, Tokio scopre il mondo nascosto di “The World”, incontra il mitico Tsubasa, protagonista della serie originale, e a lui si unisce per sconfiggere, ancora una volta, Tri-Edge.