L'improvvisa apparizione di un kaiju scatena un maremoto che devasta la cittadina portuale di Sukuba. L'enorme creatura, però, si dissolve subito in mare, trasformandosi in nutrimento per la fauna locale e portando a pesche miracolose. Per Sukuba inizia così un periodo di ricchezza e il mostro viene venerato come "la divinità della fecondità Gaea-Tima". Anche Miyako Morino, che da bambina ha perso tutto nello tsunami, trova il modo di rifarsi vendendo una statuetta che ritrae la creatura e che diventa una hit tra i turisti. Dieci anni dopo l'evento, però, ecco che nella ormai tranquilla cittadina torna a farsi vedere un kaiju...
Gaea-Tima ha da poco annientato il kaiju del sottosuolo Ingaron, quando le Forze di Autodifesa avvistano nelle acque territoriali un minaccioso oggetto volante non identificato. Mentre Miyako è tormentata dal peso della responsabilità che comporta il suo ruolo di custode di Gaea-Tima, quest'ultimo ingaggia uno scontro impari con il misterioso intruso, che si rivela un kaiju. È a questo punto che fa la sua apparizione Hibari Esashi, una sedicente guardiana di kaiju...
