Nel bel mezzo dell’epoca Edo, quella dei grandi samurai, piombano dal cielo degli alieni che si fanno chiamare Amanto, i quali, forti della loro superiorità tecnologica, conquistano la Terra. La casta dei samurai viene abolita e i nobili guerrieri privati della spada, che considerano la loro stessa anima. Tuttavia, qualcuno non è disposto ad accettare questa imposizione: si tratta di Gintoki Sakata, ragazzaccio ribelle e impulsivo, che con un gruppo di amici cerca di tirare avanti senza tradire i principi del vero samurai…
Dopo aver abbattuto i quattro guardiani Yagyu, la sfida che vede contesa Otae arriva al duello finale: Shinpachi contro Kyubei! Ma non è l’unica cosa degna di nota, tra il matrimonio di Kondo, il modo di vivere di Zenzo, la storia d’amore di Sadaharu, Katsura che frequenta un’autoscuola, lo shogun in un locale notturno e la sorella maggiore… di Okita!