Nel bel mezzo dell’epoca Edo, quella dei grandi samurai, piombano dal cielo degli alieni che si fanno chiamare Amanto, i quali, forti della loro superiorità tecnologica e conoscitiva, conquistano la Terra. Il mondo ne risulta completamente stravolto: la casta dei samurai viene abolita e i nobili guerrieri vengono così privati della spada, che è la loro stessa anima. Tuttavia c’è chi non è disposto ad accettare questa imposizione: si tratta di Gintoki Sakata, ragazzaccio ribelle e impulsivo, che con un gruppo di amici cerca di tirare avanti senza tradire i nobili principi del vero samurai…
Per salvare Shinpachi e Kagura, caduti prigionieri degli alieni, Gintoki e Katsura si introducono nella base nemica, mentre i primi due dovranno vedersela con qualcuno che sembra non avere alcuna intenzione di risparmiarli...